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科研進(jìn)展

?水生所揭示鲇屬魚(yú)類(lèi)性染色體早期演化歷程

發(fā)表日期:2024-08-14王燾來(lái)源:水生生物研究所放大 縮小

性別是真核生物的共源性狀,也是生命演化的主要驅(qū)動(dòng)力。絕大多數(shù)脊椎動(dòng)物的性別受性染色體調(diào)控,性染色體通常由常染色體獲得性別決定基因而起源。獨(dú)立的起源和性染色體的轉(zhuǎn)換致使性染色體呈現(xiàn)出高度的多樣性和易變性。模式哺乳動(dòng)物中的X和Y性染色體以及鳥(niǎo)類(lèi)中的Z和W性染色體解析得較為透徹,但是這些異形染色體都具有久遠(yuǎn)的演化歷史,很難追溯性染色體早期階段演化過(guò)程。因此,在一些非模式魚(yú)類(lèi)中,形成時(shí)間較晚的同形性染色體為闡明性染色體早期動(dòng)態(tài)演化提供了理想系統(tǒng)。

蘭州鲇(Silurus lanzhouensis)又稱(chēng)黃河鲇,是黃河流域的特色經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi),其雄性生長(zhǎng)速率和個(gè)體大小顯著優(yōu)于雌性,具有重大的性別控制育種價(jià)值。中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所桂建芳院士團(tuán)隊(duì)在前期研究中,通過(guò)人工雌核生殖鑒定蘭州鲇具有XX/XY雄性異配型性別決定系統(tǒng),開(kāi)發(fā)X和Y染色體連鎖的遺傳標(biāo)記;通過(guò)偶發(fā)的具有XY基因型的雌雄同體魚(yú)自交,獲得含有YY超雄子代自交家系(Wang et al.,2021, Aquaculture)。隨后,利用自交家系中的YY超雄魚(yú)與野生型的XX雌魚(yú)繁育,獲得XY全雄群體;該全雄群體與正常的兩性群體相比具有顯著的生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì)(4月齡體重提升17.8%);與傳統(tǒng)路徑相比,利用雌雄同體魚(yú)自交培育全雄群體的技術(shù)路徑避免了激素使用、提高了子代純度、縮短了育種周期(Niu et al.,2023, Aquaculture)。

研究團(tuán)隊(duì)在此基礎(chǔ)上,對(duì)蘭州鲇雌核生殖純化的XX個(gè)體和自交純化的YY個(gè)體進(jìn)行了從頭測(cè)序組裝,構(gòu)建出兩套高質(zhì)量的染色體水平基因組,從而獲得了無(wú)嵌合的X和Y染色體序列;通過(guò)重測(cè)序和性染色體比較分析,鑒定到24號(hào)染色體為蘭州鲇的性染色體,并在Y染色特異區(qū)域發(fā)現(xiàn)了一個(gè)性別決定候選基因amhr2y;利用染色體原位雜交、表達(dá)模式分析和基因敲除等技術(shù)手段確定amhr2y為蘭州鲇的性別決定基因;此外,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)鲇屬(Silurus)魚(yú)類(lèi)中的蘭州鲇、南方大口鲇(S. meridionalis)和鲇(S. asotus)的性染色體進(jìn)行詳細(xì)的比較分析,揭示了鲇屬祖先種24號(hào)染色體由于獲得amhr2y發(fā)生了獨(dú)立的性染色體起源,在南方大口鲇和蘭州鲇中保留24號(hào)染色體為性染色體,而在鲇中發(fā)生了從24號(hào)到5號(hào)的性染色體轉(zhuǎn)換事件;并且在鲇屬性染色體演化過(guò)程中發(fā)生了重復(fù)序列富集、基因聚集以及基因降解等現(xiàn)象。

這個(gè)研究揭示了鲇屬性別決定基因起源、重復(fù)序列擴(kuò)張、基因聚集和降解、性染色體轉(zhuǎn)化等事件,展示了一個(gè)清晰的性染色體演化早期階段的動(dòng)態(tài)過(guò)程。同時(shí),該研究也為促進(jìn)蘭州鲇精準(zhǔn)遺傳育種提供了理論和技術(shù)支撐。

鲇屬魚(yú)類(lèi)性染色體演化示意圖

該研究工作以“Genomic anatomy of homozygous XX females and YY males reveals early evolutionary trajectory of sex-determining gene and sex chromosomes in Silurus fishes”為題在線(xiàn)發(fā)表于Molecular Biology and Evolution期刊。水生所王燾博士和華中農(nóng)業(yè)大學(xué)鞏高瑞博士為該論文共同第一作者,水生所李熙銀研究員、桂建芳院士和梅潔研究員為共同通訊作者。該研究得到了中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專(zhuān)項(xiàng)(A類(lèi))(批準(zhǔn)號(hào):XDA24030505)等項(xiàng)目的資助。

論文鏈接:https://doi.org/10.1093/molbev/msae169

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