吸血節(jié)肢動(dòng)物中傳播循環(huán)的病毒有兩大類(lèi)：蟲(chóng)媒病毒（arbovirus）和節(jié)肢動(dòng)物特異性病毒（arthropod-specific virus, ASV）。蟲(chóng)媒病毒能在脊椎動(dòng)物和節(jié)肢動(dòng)物中復(fù)制，對(duì)人類(lèi)或動(dòng)物具有致病性，給全球公共衛(wèi)生來(lái)沉重負(fù)擔(dān)。節(jié)肢動(dòng)物特異性病毒僅在節(jié)肢動(dòng)物中復(fù)制，它們可能是蟲(chóng)化病毒進(jìn)化的起源。然而，目前沒(méi)有涵蓋所有已知蟲(chóng)媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒種類(lèi)、生物安全風(fēng)險(xiǎn)等級(jí)、基因組節(jié)段、地理分布等信息的綜合數(shù)據(jù)集。

      2023年5月19日，國(guó)際學(xué)術(shù)期刊Scientific Data在線發(fā)表了武漢病毒所/生物安全大科學(xué)中心袁志明/夏菡?qǐng)F(tuán)隊(duì)在蟲(chóng)媒病毒生態(tài)健康和生物安全領(lǐng)域的最新研究論文，文章題為“A global dataset of sequence, diversity and biosafety recommendation of arbovirus and arthropod-specific virus”（全球蟲(chóng)媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒的序列、多樣性及生物安全風(fēng)險(xiǎn)綜合數(shù)據(jù)集）。研究人員通過(guò)整合美國(guó)CDC蟲(chóng)媒病毒名錄（Arbovirus Catalog）、第六版《微生物和生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室生物安全》（BMBL 6th）附錄VIII-F、國(guó)際病毒分類(lèi)委員會(huì)（ICTV）的病毒分類(lèi)信息以及Genbank序列等有關(guān)信息，提取分類(lèi)學(xué)、生物安全風(fēng)險(xiǎn)、基因節(jié)段、核酸和氨基酸序列、地理分布等，構(gòu)建了首個(gè)全球蟲(chóng)媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒的綜合數(shù)據(jù)集。

      該數(shù)據(jù)集包含了（1）615個(gè)蟲(chóng)媒病毒（460個(gè)病毒種），98,994條記錄和190個(gè)節(jié)肢動(dòng)物特異病毒（180個(gè)病毒種），2,100條記錄，共包括34個(gè)病毒科，89個(gè)病毒屬和640個(gè)病毒種（圖1a）。本研究詳細(xì)展示了蟲(chóng)媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒間的基因組節(jié)段差異（圖1b）、生物安全風(fēng)險(xiǎn)建議等級(jí)（圖1c）、病毒及其節(jié)肢動(dòng)物媒介的全球分布、宿主來(lái)源等特征（圖1d）。為深入理解蟲(chóng)媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒的相互作用、進(jìn)化規(guī)律和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估提供了豐富的數(shù)據(jù)資源（圖2）。

      武漢病毒所博士后黃英、博士研究生汪順龍和山東理工大學(xué)副教授劉紅為論文共同第一作者，武漢病毒所夏菡青年研究員和浙大城市學(xué)院明朝燕副教授為論文共同通訊作者，武漢病毒所袁志明研究員、美國(guó)德州大學(xué)醫(yī)學(xué)分部Sergio Rodriguez助理教授為該項(xiàng)研究的合作作者。該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目和中科院中非中心項(xiàng)目等項(xiàng)目的資助。

圖1. 蟲(chóng)媒病毒和節(jié)肢動(dòng)物特異病毒的分類(lèi)、基因組節(jié)段和生物安全分級(jí)建議和宿主來(lái)源 

圖2. figshare數(shù)據(jù)集部分信息 

文章鏈接：

https://www.nature.com/articles/s41597-023-02226-8

數(shù)據(jù)鏈接：

https://figshare.com/articles/dataset/A_global_dataset_of_viral_sequence_diversity_and_distribution_of_arboviruses_and_arthropod-specific_viruses/22154573?file=40281991